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神经消化内科成立于1990年，诊疗范围涵盖了神经内科、消化内科及老年医学。开放床位71张，共有医务人员29人。

皮肤科开展皮肤病及性病相关的诊疗工作。科室现有二氧化碳点阵激光治疗仪，红蓝光治疗仪，真菌荧光检测仪，皮肤镜等先进医疗及检测设备，且可提供性病（其中包括梅毒、HIV、尖锐湿疣等）及过...

长春市第二院呼吸、内分泌科，以治疗呼吸系统常见病、多发病及糖尿病等内分泌代谢病为专科特色。是中华医学会糖尿病学会妊娠糖尿病关爱项目基地；吉林省营养师学会 糖尿病膳食营养教育指导基...

骨科是长春市医学重点专科，开放床位50张，现有医生10人，其中主任医师3人，副主任医师5人，主治医师1人，医师1人。科室所有医生均有北京、上海等综合医院以及国外进修经历。

妇科配有超导可视无痛人流机、数码电子阴道镜、利普刀、微波、红光及输卵管通液术等先进设备。 科室可以诊治妇科炎症（外阴、阴道、盆腔炎等）及内分泌、不孕症、肿瘤、及更年期综合征。

急诊科提供全年365天，全天24小时方便、快捷的急诊急救医疗服务。目前拥有除颤仪、多功能监护仪、喉镜、洗胃机、心电图机、微量注射泵等医疗设备，随时满足危急重症的院前、院内的救治需求。

长春市第二医院多学科诊治中心是吉林省重症医学专科联盟成员单位，同时还是吉林省急危重症 .高压氧专科联盟成员单位。